Subject: "Бластинг" - куда? immunol. Добрый день!Недоумеваю, как перевести вот этот вот "бластинг" Blasting this epitope into Blastp from the National Center for Biotechnology Information (NCBI) reveals that it is a highly conserved epitope with 100% homology within the top 100 blast hits corresponding to HERV-K-Env sequences Насколько могу догадаться, речь идет о выравнивании и сравнении последовательностей. Но этот вот оборот "blasting... into" вводит в ступор... Спасибо! |
Погуглил тут... Вот так похоже на правду? Сравнение этого эпитопа с использованием сервиса Blastp из базы данных NCBI выявило, что он представляет собой высокостабильную антигенную детерминанту, со 100% гомологией соответствуя в пределах верхних 100 бласт-хитов последовательностям HERV-K. (Ужжжжос-ссс) |
Это профжаргон (мы в лаборатории применяли кальку «бластовать»). BLAST - это компьютерная система сравнения последовательностей (нуклеотидных, аминокислотных и т.п.). В Вашем контексте под blasting подразумевается «взять последовательности, запихать их в этот BLAST и сравнить». |
Спасибо, xand! А мой вариант у Вас профессионального рвотного рефлекса не вызывает? (в частности, заключительная часть фразы)? |
Я бы ничего не понял. Попробуйте сформулировать по такому алгоритму: Вашу последовательность прогнали через БЛАСТ для сравнения с последовательностью этого HERV-K-Env Выяснилось, что она представляет собой эпитоп с высокой степенью консервативности, со 100% гомологией, и входит в число «top 100 blast hits» Теперь становится веселее. Результаты сравнения последовательностей выводятся по степени гомологичности, по нисходящей. top 100 blast hits - это первые 100 результатов сравнения, которые дают максимальную степень структурной гомологии (самая высокая степень совпадения с изучаемой последовательностью) Ваша последовательность попала в эту сотню. Теперь нужно это все как-то в кучу слепить, попробуйте. |
ОК, понял, благодарен премного! |
You need to be logged in to post in the forum |