Subject: insertion sequences by double-incorporation chem. Прошу помощи в переводе куска, посвящённого твердофазному пептидному синтезу (рост аминокислотной цепи на смоле-линкере).Выше речь идёт о том, что менее технологичные реактивы этой реакции были заменены на более технологичные. В результате: This change result in greater control over formation of insertion sequences by double-incorporation of the activated amino acid derivative and racemization. Additionally, the acidic coupling reagents reduce the racemization potential during the coupling reactions. acidic coupling reagents - скорее всего имеется в виду один из "новых" реактивов, имеющий ацетатную группу. Рацемизация, как я понял, не приветствуется. В силу своего химического профиля не понимаю остального химического смысла этих 2 фраз, а переводить "машинально" не хочется. Буду очень благодарен за вариант осмысленного перевода. |
удвоение и рацемизация аминокислотных остатков не приветствуются но внесённые изменения улучшают контроль над этими процессами coupling reactions - реакции формирования (образования) амидной связи coupling reagents - реагенты (или добавки (хотя это additives) для пептидного синтеза acidic - кислотный реагент а там у вас даются примеры этих реагентов, чтобы знать наверняка, что это ацетатная группа, а не какая-нибудь другая? |
соответственно данные реагенты (добавки) снижают рацемизацию |
1. Да, ethyl (hydroxyimino)-cyanoacetate (Oxyma) 2. Как всё же перевести insertion sequences by double-incorporation? |
гарпия, заодно не подскажете, что такое в пептидной химии "deletion impurities"? У меня: The acceptance criterion for the Fmoc deprotection end-point was tightened from 0.5% to 0.1% for coupling cycles 1 to 6 in order to reduce the potential for formation of deletion impurities. Нашел ссылку (http://www.ebay.com/itm/ADVANCED-CHEMTECH-AAPPTEC-APEX-396-MULTIPLE-PEPTIDE-SYNTHESIZER-APEX-DCFWS-/231287758163/?_ul=BY)? The Apex 396 parallel peptide synthesizer produces higher yields of complete peptides with fewer deletion impurities. Но, к сож-ю, эта ссылка ничего не проясняет. |
касательно ацетатной группы лучше перевести то, что написано (т.е. acidic), и не додумывать любая последовательность пептида, не соответствующая заданной, есть impurity нарушения в синтезе могут выражаться потерей нужного в данном месте а/к остатка - deletion, когда пептид получается укороченный или удвоением остатков (скажем, должен быть один аланин, а их два) |
Спасибо за ликбез, всё стало более-менее понятно, кроме одного: как сформулировать перевод "deletion impurities". "Примеси нарушений роста цепи"? Есть термин "делеция", но он относится к генетике. |
"deletion impurities" м.б. "примеси укороченных пептидов" |
есть deletion sequences, а есть truncated sequences в обоих случаях это "укороченные", но по сути это разные механизмы в первом случае какие-то а/к остатки не вставились, а во втором пептид оборвался продукт синтеза проще очистить от truncated sequences, чем deletion sequences, т.к. truncated заметно отличаются по структуре от конечного продукта надо написать что-то типа "укороченные пептиды, в которых отсутствует один или более аминокислотных остатков" |
@надо написать что-то типа "укороченные пептиды, в которых отсутствует один или более аминокислотных остатков" ну, truncated под это определение тоже подходят :) тогда уже "укороченные пептиды, в которых отсутствует один или более аминокислотных остатков в середине цепи" лично я назвал бы truncated "усеченными" или фрагментами |
glomurka, спасибо! |
You need to be logged in to post in the forum |