сборочная ПЦР(используют для сборки синтетических молекул ДНК из отдельных фрагментов, напр., чтобы получить синтетические гены или даже целые геномы. Wolfskin14)
ПЦР для отбора колоний(Данную методику используют для непосредственного определения в колониях E.coli присутствия или отсутствия вставок ДНК в плазмидных конструкциях. neb.comWolfskin14)
метилчувствительная ПЦР(основана на неспособности ряда рестриктаз расщеплять сайт узнавания при наличии в нем 5-метилцитозинов; в этом случае ПЦР с праймеров, соответствующих участкам ДНК вокруг сайта узнавания, приводит к образованию расчётного фрагмента ДНК, тогда как неметилированный сайт будет расщепляться и продукт ПЦР не образуется dzimmu)