 |
|
Subject: Коллеги, понимающие в генетике, прошу вашей помощи! genet. Уважаемые коллеги-генетики, биологи, помогите, пожалуйста, разобраться с фразой:"Such sequencing could use single, long reads spanning CDR3 (“long read”) technology, or could instead involve shotgun assembly of the longer sequences using fragmented libraries and higher throughput shorter sequence reads." Не могу понять что такое spanning, shotgun assembly, и вообще что к чему в этой фразе:( Контекст из патента "Измерение смещений амплификации в мультиплексных реакциях ПЦР"). Огромное спасибо за ответы! |
|
shotgun sequencing - определение последовательности длинных фрагментов ДНК методом дробовика, при кот. из молекулы ДНК выделяются участки, кот. считываются -> массив коротких последовательностей (цепей т.е. reads) -> идет сборка полученых фрагментов в большую последовательность (assembly). при чтении даже коротких последовательностей м.б. ошибка -> long reads spanning - считывание длинных участков без "дробления". CDR - complementarity determining regions - участки, определяющие комплементарность |
| "что к чему", видимо так: При этом секвенировании можно использовать технологию длинных ридов, или можно использовать метод дробовика (нащелкать коротких фрагментов, а потом собирать из них большие последовательности), при котором применяются фрагментированные библиотеки и высокопроизводительные средства работы с короткими ридами |
| гарпия, glomurka, благодарю за помощь! |
| You need to be logged in to post in the forum |