Оформление сопутствующих документы на отправляемый экспортный Груз, в т.ч. оформление Поручения на погрузку судов для экспорта с разрешающим штампом таможни.

Execution of accompanying documents for the exported Cargo including issuing of Vessel Loading Order for export with customs permit stamp.

Простая логика подсказывает, что поручения на погрузку импортных грузов никто (из тех, кто в теме) не выписывает, ибо их только выгружают с судов.

Вот если бы речь шла о поручениях на вагоны!
Но они, эти поручения на погрузку импортного груза (прибывшего в порт), следующего вглубь страны, традиционно назывались и продолжают, кажется, еще называться "разнарядками".

Так что экспорт надо все-таки приклеивать во фразу -- без него нельзя.

как их разграничить и следует ли это делать? ведь и то, и то переводится как shipping document?

нет
это разные доки
и по-английски их надо разводить

Транспортные документы (transportation docs)
http://mctpp.chat.ru/doc9.htm

остальное тоже имеет право и место жить под этим солнцем
но сайт я даже открывать этот не хочу

Read more: http://www.businessdictionary.com/definition/shipping-documents.html#ixzz2nvoEQQp1

packing list (упаковочный лист) и инвойс у нас относятся к товаросопроводительным, а авианакладная - к транспортным.

Остается одно - считать их все товарно-транспортными документами.