DictionaryForumContacts

 ochernen

link 6.04.2012 23:47 
Subject: ДСН-ПААГ-электрофорез: Total Band Area pharma.
ДСН-ПААГ
..идет перечень рисунков:
Figure 1 Linearity Gel Image
Figure 2 Linearity Curve for Total Band Area of Gel 1

..как перевести..
Рисунок 1 Линейность, гель-электрофоретическое изображение
..или Рисунок 1 Гель-электрофоретическое изображение для определения линейности

Рисунок 2 Кривая линейности для значений общей площади полос Гель-изображения 1??

..честно говоря что первое не нравится что второе..
что такое Total Band Area ?

Помогите пожалуйста.
Заранее благодарен.

 123:

link 7.04.2012 0:01 
protein Band = полоса белка

Following electrophoresis, the gels are stained for detection and quantitation of the separated proteins. Fluorescent stains are commonly used for this purpose due to the high sensitivity and wide dynamic range possible using fluorescent reagents. Quantitation is most reliable when the fluorescence response is linear with respect to the amount of protein over the widest possible range.

http://www.bio-rad.com/webroot/web/pdf/lsr/literature/Bulletin_5705.pdf

 123:

link 7.04.2012 0:05 
... у вас какой секвенатор?...

Современные секвенаторы можно разделить по типу проводимого электрофореза на капиллярные и те, в которых разделение происходит в гелевых пластинах. Последние могут также различаться по количеству детектируемых красителей: один, два или четыре. Капиллярные секвенаторы выпускаются только в варианте, использующем детекцию четырех флуоресцентных красок.

Для эффективного разделения напряжение должно составлять 30-50В на см длины геля. Важным условием при проведении э/ф является однородность температуры по всей поверхности геля. Неравномерный нагрев геля и стекол во время электрофореза способен привести к разнице в скоростях движения фрагментов ДНК по ширине геля и, как следствие, к искажению результатов. Для борьбы с этим явлением используют тонкие (обычно 0.4 - 0.1 мм) гели и принудительный подогрев стекол. В автоматическом секвенировании помимо электрофореза в пластинах полиакриламида чрезвычайно популярен капиллярный электрофорез в линейном полиакриламиде. Капилляры представляют собой стеклянную трубку длинной 30-100 см, закатанную в полимерный пластификатор. Небольшой диаметр капилляра (50-100 мкм) позволяет проводить разделение значительно быстрее, чем в обычных гелях. Кроме того, капиллярные секвенаторы позволяют обеспечивать гораздо более высокую чувствительность за счет отсутствия горизонтальной диффузии.

 123:

link 7.04.2012 0:09 
...еще, как мне кажется, по поводу "Total Band Area of Gel" ...

Разрешение проблемы было найдено использованием для идентификации полос в геле флюоресценции вместо радиоактив­ности. На основе дихлорородамина были разработаны четыре флюоресцентных красителя разных цветов, с максимами излуче­ния при 544, 569, 597 и 622 тц, лежащими в зеленой, желто-зеле­ной, оранжевой и красной областях спектра и легко разделимыми в спектрофотометре. Авторам удалось связать эти красители с четырьмя дидезоксирибонуклетидами. Таким образом при ла­зерном облучении геля каждая полоса в методе Сенджера при электрофорезе в одном треке заявляла о своей специфичности соответствующим цветом излучения. Разумеется, каждая полоса в геле, в силу своей конечной ши­рины и некой кривой распределения вещества по этой ширине, испускала свет флюоресценции тоже в виде некоего кол околообразного пика интенсивности света, растянутого в направлении электрофореза. В нижних своих частях эти пики могли перекры­ваться (как перекрывались своими границами и соответствующие полосы в геле). Но вершины пиков хорошо отделялись друг от друга, и это позволяло прямо по этим вершинам определять по­рядковый номер каждого нуклеотида. А его индивидуальность — по цвету пика.

 ochernen

link 7.04.2012 8:59 
..за полосу в геле Спасибо.., а Linearity Gel Image это что?
Total Band Area of Gel 1 = общая площадь пика для полосы в геле?? запутался...

 123:

link 7.04.2012 9:05 
,.. надо отталкиваться от контекста ... без контекста я могу лишь предположить, что речь идет о такой характеристике (линейной зависимости) как "fluorescence response is linear" ... но что это означает в данном случае и что из себя представляют "Gel Image" я затруднясь сказать ... попробуйте сами сварганить что-нибудь удобоваримое из того, о чем говорится в вашей статье ...)))

 ochernen

link 7.04.2012 9:11 
To 123: Спасибо!
п.с. ..текст от тех же индийско-китайско-американских авторов, ...с предыдущим текстом которых Вы и многие другие (Всем Спасибо!) помогали мне ранее...

 123:

link 7.04.2012 9:15 
...не за что ... вы почитайте на русском языке - мне кажется, что Gel Image - это флюоресцеирующая полоса в геле ... или пятно - не знаю, надо же видеть эти рисунки, а не гадать ...

 ochernen

link 7.04.2012 10:17 
даю ссылку на картинку:
http://savepic.net/2747410.htm

 123:

link 7.04.2012 10:30 
...имхо... Figure 1 Linearity Gel Image =
Рисунок 1. Флюоресценция (при электрофорезе) в линейном полиакриламидном геле

 123:

link 7.04.2012 10:39 
...как-то так, наверное ...)))

Total Peak Area = Общая площадь пика
Total Band Area = Общая площадь флюоресценцентного пятна, соответствующая полосе белка
Linearity Curve for Total Band Area of Gel 1
= Линейная зависимость общей площади флюоресценцентного пятна в Геле1, соответствующего полосе белка, от количества белка в растворе

 ochernen

link 7.04.2012 10:43 
Спасибо 123! Подскажите еще дилетанту пожалуйста - на фотке это пятна?? Не полосы??

 123:

link 7.04.2012 10:49 
...мне кажется, что это и есть те самые "колоколообразные пики интенсивности света", о которых говорится в источнике, процитированном в посте от 7.04.2012 3:09 ...
... там они именуются "пиками" ...

 123:

link 7.04.2012 10:51 
ochernen ... вы того не того ... я в этой хроматографии сам полный профан ... начитался на ходу источников и вам того же желаю ... ))))

 

You need to be logged in to post in the forum