Особенно непонятно - ...a couple shift codes that ended up being kept for backwards compatibility reasons

по-видимому, существует как минимум две системы использования этих кодов:
To distinguish EBCDIC data from DBCS data, two shift code systems are used. The first system, called the Wrapping shift code system, takes the form of two codes -- one code preceding and the second following the DBCS data. (...)
The second system of shift codes, called Header shift codes, uses a one- or two-byte code to identify that the following byte is a binary number whose value defines the amount of non-EBCDIC data that follows. http://www.ncdhhs.gov/dirm/team51/download/reference%20guide.pdf

Возможно, shift code consolidation и a couple shift codes that ended up being kept for backwards compatibility reasons означает, что в этих системах навели порядок, все коды переписали, чтобы они соответствовали какой-то одной выбранной системе, но несколько оставили в прежнем виде, чтобы обеспечить обратную совместимость.